I colori della maglia dell'Isernia Football Club sono il bianco e il celeste.
Il simbolo dell'Isernia Football Club é¨ uno scudo sannitico. La cornice di colore blu forma nella parte superiore un riquadro rettangolare con all'interno la scritta in maiuscolo Isernia F.C. All'interno lo sfondo é¨ suddiviso obliquamente in due settori, bianco e celeste. In posizione centrale é¨ presente un pallone da calcio, su cui campeggiano le iniziali della città composte da un bastone intorno al quale é¨ attorcigliato un serpente.
Cronistoria della squadra di calcio 'Isernia|      Anno     |    Descrizione |
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| 1927-1928 | 5° nel girone unico della Terza Divisione Abruzzese con la denominazione ''Samnium Isernia''. |
| 1932-33 | Isernia |
| 1934-1935 | Isernina ? nel girone C della Terza Divisione Campania. Ammessa al girone finale. |
| 1943-1944 | Attività sospesa per cause belliche |
| 1951-1952 | Isernia |
| 1953-1954 | Pol. Isernia |
| 1954-1955 | U.S. Saetta Isernia |
| 1956-1957 | U.S. Isernia 14° nel girone A della Promozione Campana. |
| 1957-1958 | 5° nel girone A Campano del Campionato Nazionale Dilettanti. |
| 1958-1959 | U.S. Isernia e F. Isernia partecipano al girone A Campano del Campionato Nazionale Dilettanti. U.S. Isernia ammessa alla nuova Prima Categoria Campania. |
| 1959-1960 | ? nel girone A della Prima Categoria Campania. |
| 1960-1961 | ? nel girone A della Prima Categoria Campania. |
| 1961-1962 | ? nel girone A della Prima Categoria Campania. |
| 1962-63 | |
| 1963-64 | |
| 1964-65 | |
| 1965-66 | S.S. Aesernia |
| 1966-67 | |
| 1967-68 | |
| 1968-69 | |
| 1969-70 | |
| 1970-71 | ? nel girone ? della Prima Categoria Campania. |
| 1971-72 | ? nel girone ? della Prima Categoria Campania. Promossa in Promozione. |
| 1972-1973 | 6° nel girone A della Promozione Campania. |
| 1973-1974 | 5° nel girone A della Promozione Campania. |
| 1974-1975 | 10° nel girone A della Promozione Campania. |
| 1975-1976 | 3° nel girone A della Promozione Campania. |
| 1976-1977 | 2° nel girone A della Promozione Campania. |
| 1977-1978 | ? nel girone A della Promozione Campania. |
| 1978-1979 | 2° nel girone A della Promozione Campania. |
| 1979-1980 | 2° nel girone A della Promozione Campania. |
| 1980-1981 | 4° nel girone A della Promozione Campaniae. Ripescata nel Campionato Interregionale. |
| 1981-1982 | 5° nel girone H del Campionato Interregionale. |
| 1982-1983 | 13° nel girone H del Campionato Interregionale. |
| 1983-1984 | 1° nel girone H del Campionato Interregionale. Promossa in Serie C2. |
| 1984-1985 | 13° nel girone D della Serie C2. |
| 1985-1986 | 18° nel girone C della Serie C2. Retrocessa nel Campionato Interregionale. |
| 1986-1987 | 16° nel girone G del Campionato Interregionale. Retrocessa in Promozione. |
| 1987 | A fine stagione viene decretato il fallimento della S.S. Aesernia. Una nuova società con la denominazione di Isernia '86 riparte dalla Promozione Campania. |
| 1987-1988 | 16° nel girone A della Promozione Campania. Retrocessa in Prima Categoria. |
| 1988-89 | ? nel girone della Prima Categoria Campana. Promossa in Promozione Campana. |
| 1989-1990 | 14° nel girone A di Promozione Campana. Retrocessa in Prima Categoria. |
| 1990-91 | ? nel girone della Prima Categoria. Promossa in Promozione. |
| 1991-92 | ? nel girone ? della Promozione Molise. Promossa in Eccellenza. |
| 1992 | Cambia denominazione in Polisportiva Isernia. |
| 1992-1993 | 14° nel girone unico dell'Eccellenza Molise. |
| 1993-1994 | 7° nel girone unico dell'Eccellenza Molise. |
| 1994-1995 | 5° nel girone unico dell'Eccellenza Molise. |
| 1995-1996 | 13° nel girone unico dell'Eccellenza Molise. |
| 1996-1997 | 3° nel girone unico dell'Eccellenza Molise. |
| 1997-98 | 1° nel girone unico dell'Eccellenza Molise. Promossa nel Campionato Nazionale Dilettanti. Vince la Coppa Italia Dilettanti Molise. |
| 1998 | Dalla fusione con l'Isernia Calcio nasce l'Isernia Football Club. |
| 1998-1999 | 5° nel girone G del Campionato Nazionale Dilettanti. Ammesso nella nuova Serie D. |
| 1999-2000 | 8° nel girone H della Serie D |
| 2000-2001 | 11° nel girone H della Serie D |
| 2001-2002 | 4° nel girone G della Serie D |
| 2002-2003 | 1° nel girone G della Serie D. Promossa in Serie C2. |
| 2003-2004 | 14° nel girone C della Serie C2. |
| 2004 | Viene decretato il fallimento dell'Isernia F.C. |
| 2004-05 | Il sodalizio é¨ inattivo. |
| 2005 | Nasce anche l'A.S.D. Isernia Pentra Sport, ammessa nel girone A di Prima Categoria Molise |
| 2005-2006 | 2° nel girone A della Prima Categoria Molise. Vince gli spareggi promozione. Promossa in Promozione. |
| 2006-2007 | 5° nel girone unico della Promozione Molise. Perde la finale play-off. Ripescato in Eccellenza. |
| 2007-2008 | 14° nel girone unico dell'Eccellenza Molise. Perde i play-out. Retrocesso e successivamente ripescato. |
| 2008-2009 | 14° nel girone unico dell'Eccellenza Molisana. Perde i play out. Retrocesso in Promozione. |
| 2009-2010 | 14° nel girone unico della Promozione Molise. Perde i play out. Retrocesso in Prima Categoria Molise. |
| 2010 | La prima squadra della città diventa il Real Isernia. |
| 2010-2011 | 1° in Eccellenza Molise. Promosso in Serie D. Vince la Coppa Italia Dilettanti Molise. |
| 2011 | Cambia denominazione in Isernia F.C. |
| 2011-2012 | 5° nel girone F della Serie D. Perde la semifinale play-off. |
| 2012-2013 | 13° nel girone F della Serie D. |
| 2013-2014 | 17° nel girone F della Serie D. Retrocesso in Eccellenza. |
| 2014-2015 | 1° in Eccellenza Molise. Promosso in Serie D. Vince la Coppa Italia Dilettanti Molise. |
| 2015-2016 | 15° nel girone F della Serie D. Perde i play-out contro il Monticelli. Retrocesso in Eccellenza. |
| 2016-2017 | 3° in Eccellenza Molise. Perde la finale play-off contro il Vastogirardi. |
| 2017-2018 | 1° in Eccellenza Molise. Promosso in Serie D. |
